FFU的典型使用方式是,新风由新风空调机处理至所需状态后送入,在静压箱内与回风混合后经FFU的风机加压后经HEPA或ULPA送入室内,再经架空地板或侧墙回至干盘管,在此经冷(热)处理后经由回压机送回至静压箱完成循环。这样的FFU系统有诸多优点：
　　 1、系统灵活，可随时调整　
　　 洁净室的壁板都是以天花板格子的模数来布置，并且由于其特殊的节点构造，洁净室的壁板可以随时调整位置，以此改变房间的布局。如果房间的洁净度需要调整，可以通过增减FFU数量来实现。这对于集中送风的净化系统来说几乎是不可能的。
　　 2、 出风均匀稳定
　　 FFU因为自带风机，出风均匀而稳定。避免了集中送风系统各送风口风量平衡的问题。对于垂直单向流洁净室尤为有利。
　　 3、节能显著
FFU系统风管很少，除新风以风管送达外，大量的回风以小循环的方式运行，大大的减少了风管的阻力消耗。同时由于FFU的面风速一般为0.35~0.45m/s,过滤器阻力小,FFU的无壳风机功率很小,新型的FFU采用了高效率电动机,同时对风机叶轮形状进行了改进,其综合效率已大幅度提高。
　　 4、 节省空间
　　 FFU没有巨大的送回风管，大大的节省了安装空间。对于层高紧张的改建项目非常合适。
　　 5、 风口、灯具、烟感、喷淋、静电中和器等的合理布局
这些洁净室常用装置在安装时都有各自的天花板格子位置，既合理又美观。
　　 6、负压密封
　　 FFU送风系统的静压箱为负压，因此即使风口安装存在泄漏，也是从洁净室向静压箱泄漏，不会形成对洁净室的污染。
FFU系统也有缺点：
风机数量大，故障机率大。且因FFU布置在吊顶上，维修有一定困难。而集中送风系统因设备较为集中，数量也少，易于维护。